23948sdkhjf

Fenomenalt för metabolomik

| Av Boel Jönsson | Tipsa redaktionen

EMBLs institut för bioinformatik EBI och 13 partners har lanserat PhenoMeNal, en online-tjänst för storskaliga metabolomikanalyser.

PhenoMeNal ska göra det möjligt för forskare och kliniker att utföra komplicerade metabolomikanalyser i molnet. Exempelvis kan man söka efter mönster i en patients data och använda fynden för förbättrad sjukdomsspårning och optimera behandlingen.

Läs också: Nationell satsning på precisionsmedicin

Metabolomik har potential att bli ett viktigt verktyg för precisionsmedicin, individualiserad vård. Metabolomik innebär studiet av småmolekyler, metaboliter, som finns i alla celler, kroppsvätskor, vävnader och organ. Koncentrationen av dem reflekterar underliggande biokemisk aktivitet och därmed tillståndet i celler och vävnader och avslöja om en patient har en viss sjukdom.

"Efter tre års gemensam utveckling är nu PhenoMeNal klart att ta emot användare. Onlineportalen använder state-of-the-art-metoder för att förstå molekylära orsaker bakom hälsa, åldrande och sjukdom. Forskare kan utan programmeringserfarenhet enkelt och säkert analysera patientdata. PhenoMeNal gör det möjligt att få en bättre bild av hur enskilda patienter skiljer sig år på molekylär nivå – detta är nyckeln till precisionsmedicin", säger Namrata Kale, projektledare vid EMBL-EBI, i ett pressmeddelande.

Portalen utnyttjar ELIXIR Authorisation and Authentication Infrastructure som gör användningen säker.

"PhenoMeNal har hjälpt oss att strömlinjeforma våra dataanalyser och att lösa flera datautmaningar. Nu gör vi alla våra metabolomikanalyser i datormiljöer som har utvecklats inom PhenoMeNal", kommenterar Kim Kultima, forskare vid Uppsala Universitet.

"Vi uppmanar forskare som arbetar med metabolomik att utforska PhenoMeNal och testa verktyg och arbetsflöden och skicka oss feedback från sajten. Vi hoppas kliniska forskare överallt kommer att använda den", säger Namrata Kale.

Bland de 13 partners som ingår i konsortiet bakom PhenoMeNal finns Uppsala universitet, Oxforduniversitetet, Imperial College London, Leibniz institut för växtbiokemi, Leidenuniversitetet och det schweiziska institutet för bioinformatik (SIB).

EMBLs Europeiska Bioinformatikinstitut, EBI, är placerat på Wellcome Genome Campus. strax söder om Cambridge. Projektet har finansierats av EUs program för forskning och innovation Horison 2020 (Anslag nr 654241).

European Molecular Biology Laboratory (EMBL) är Europas flaggskeppslaboratorium för molekylärbiologisk grundforskning.

Håll dig uppdaterad med Kemivärlden Biotech
Är du prenumerant? Bli prenumerant

Med en prenumeration får du obegränsad tillgång till webbtidningen. Läs webbtidningen online.

Kommentarer (0)
Startsidan just nu

100 miljoner till flytande biogas

Energigas Sverige får ansvar för att driva ett innovationskluster för flytande biogas.

Forskarna svarar om Pcure-kritiken

Pharem slår tillbaka mot Akademiska

En publicerad studie från forskare vid Akademiska sjukhuset pekar mot att Pcures läkemedelsrening i toalettstolen inte fungerar. Artikeln borde dras tillbaka och studien göras om, skriver Pharems vd.

Akademiska spolar Pcure

Nu har Akademiska gjort en större studie av enzymblocken som skulle rena läkemedelsrester redan i toalettstolen. Resultatet är nedslående.

Jästolja kan ersätta palmolja

Den olja, t ex palm- eller sojaolja, som används i fiskfoder kan ersättas med “fet jäst” som odlas på halmsubstrat.

Reningsverk blir bioraffinaderier

Nyhetsbrev

Tunna filmer ger lägre avtryck

En livscykelanalys visar på betydligt lägre koldioxidavtryck från Midsummers tillverkningsprocess för tunnfilmssolceller än den för kiselceller.

Arkiv

Pallplats för Gedea

Gedea Biotech placerade sig på plats tre i gårdagens Europafinal av EIT European health catapult, i kategorin Biotech.

Ny glaskeram för tandlagning

Forskare på Ångströmlaboratoriet vid Uppsala universitet har tagit fram glaskeramer lämpliga som tandlagningsmaterial, som är tre gånger starkare än befintliga.

Perstorp säljer Capa

Specialkemikalieföretaget Perstorp kommer att sälja sin kaprolaktonverksamhet inklusive produktionssajten i Warrington.

Epilepsigener pekar mot ny behandling

I den största internationella studien i sitt slag har 11 nya gener kopplade till epilepsi upptäckts.

Cyclicor får ny vd

Lundaforskarna bakom Cyclicor har utvecklat en metod för att producera giftfria polymerer, plaster.

Storkoncern investerar – mer kapacitet behövs

EU satsar på barnlöshet

Det svensk-danska projektet ReproUnion för specialiserade behandlingar av ofrivillig barnlöshet får förnyat stöd från bl a EU.

Letar skadliga ämnen i damm

Därför har vi inte håriga handflator

Hår eller inte hår är något som upptar en stor del av människans tid. Nu har forskare hittat en delförklaring till varför fotsulor är hårlösa

Bayer skär ned kraftigt

Dyr teknik avlägsnar mikroplaster

I ett nytt samarbetsprojekt bekräftas att membranteknologi effektivt avlägsnar mikroplast från avloppsvatten.

Genombrott för fotokatalysator av järn

Lundaforskare har framgångsrikt lyckats optimera en järnmolekyl som kan användas som fotokatalysator för att producera bränsle och i solceller för att framställa el.

De ska boosta IVA

Nationell satsning på precisionsmedicin

Nu växlar Sverige upp arbetet med precisionsmedicin inom hälso- och sjukvården och den kliniska forskningen.

Forskar Grand Prix avgjort

Den nationella finalen av Forskar Grand Prix har avgjorts i Stockholm och en vinnare har korats.

Unga forskare prisas

Upptäckt koppling mellan tarmfloran och fetma belönas när pris för unga forskare delas ut i Stockholm.

Kinesiska tvillingar kan vara världens första genediterade barn

Forskare reagerar starkt på nyheten om ett kinesiskt tvillingpar som fötts efter att deras genom editerats med Crisper-Cas9.

1

Tredje gästprofessorn för klimatet

Ny styrelseorförande för UIC

Ny chef på Sobi

Se alla Företagens egna nyheter

Sänd till en kollega

0.657