23948sdkhjf

Jättegenom kartlagt

| Av Boel Jönsson | Tipsa redaktionen

Efter fjorton års arbete publicerar forskarna i International Wheat Genome Sequencing Consortium ett utkast och säger att de i stort sett är framme.

Risets genom publicerades 2002, sojabönan 2008, majs 2009. Nu är det dags för vete, världens viktigaste gröda, som förser oss med en femtedel av våra kalorier.

Läs också: Dom i patentstriden om CRISPR-Cas9

Att det har tagit så lång tid beror på att vete har det mest komplexa genomet vi känner till.

Det är enormt stort, med 16 miljarder DNA-bokstäver (kvävebaser). I jämförelse har Arabidopsis 135 miljoner och det humana genomet 3 miljarder bokstäver. Egentligen är vetets genom tre i ett, vilket gör det hela ännu besvärligare.

För ca 500 000 år sedan hybridiserade två gräsarter till en (emmervete). När vi människor domesticerade plantan kom en tredje gräsvariant in i bilden. Därför har modernt brödvete tre par av varje kromosom, en s k hexaploid variant.

Vanligen sekvenseras genom genom att DNA bryts ned i små segment som avläses separat och sedan sätts ihop. Men om varje kromosom förekommer sex gånger blir det väldigt svårt att veta hur det ska ske.

För att göra det ännu värre består 85 procent av vetets genom av repetitiva sekvenser vilket gör det mycket komplicerat att sätta ihop även om man vet vilken kromosom en bit hör till.

Ett vetegenom som släpptes förra året av ett forskarlag vid Johns Hopkins-universitetet (Salzberg) är inte så detaljerat.

Det konsortiet nu har är ett nästan komplett genom av vetesorten Chinese Spring; drygt 107 000 gener är kartlagda i detalj för att vara till nytta för växtförädlare.

Läs också: Globalt avtal om CRISPR

Det viktiga är att förse dem med en bättre verktygslåda, och det kan man redan se. Forskare har hittat en länge eftersökt gen som styr vetestråets uppbyggnad. Med fler kopior av den genen får vetet en solid stjälk istället för ihålig, och blir motståndskraftigare mot torka och insektsangrepp.

Möjligheterna som öppnar sig är många. En är att man kan identifera gener som kodar för de olika veteproteinerna, t ex gluten, vilket gör forskning om vetets egenskaper enklare.

Ett problem för växtförädlare i EU är beslutet nyligen att CRISPR-redigerade genom ska räknas som GMO, även om inga externa gener har tillförts.

Länk till abstract

Shifting the limits in wheat research and breeding using a fully annotated reference genome

Mer om: CRISPR | vetets genom


Håll dig uppdaterad med Kemivärlden Biotech
Är du prenumerant? Bli prenumerant

Med en prenumeration får du obegränsad tillgång till webbtidningen. Läs webbtidningen online.


Skriv din kommentar
Inläggen nedan modereras inte i förväg och omfattas därmed inte av webbplatsens utgivningsbevis.
Startsidan just nu

SOBI storhandlar från AstraZeneca

Swedish Orphan Biovitrum AB (Sobi) har ingått avtal med AstraZeneca, om att förvärva rättigheterna till Synagis (palivizumab) i USA för 13,6 miljarder kronor.

Superplast för bättre tandlagning

Forskare vid KTH har tagit fram ett superstarkt och biokompatibelt material som är mycket bättre än det som idag används för att laga tänder.

Över 60 läkemedel hittade i spindlar

Den ökande användningen av läkemedel sätter allt tydligare spår i naturen visar en ny internationell studie med forskare från bl a Umeå universitet och SLU.

Sockerkonsumtionen behöver halveras

Det budskapet presenterar Kostfonden på Världsdiabetesdagen den 14 november när man dukar upp den mängd sötsaker som produceras åt en svensk tvåbarnsfamilj årligen.

Merck slutar sälja rotavirusvaccin i Västafrika

AstraZeneca ökar försäljningen

Nyhetsbrev

Jämställdhet brister för kvinnliga kemister

Arkiv

Doktorand förgiftade kollega

En doktorand i kemi vid Queens Universitet i Kingston, Canada, erkänner att han har förgiftat en kollega med nitrosodimetylamin.

Kemibolag i råvarusamarbete

Wellcome och Gates Foundation stödjer Open Access

Idag måndag har båda organisationerna gått med i cOAlition-S och uttalar sitt stöd för principerna i den s k Plan S.

Skarp forskarprotest mot Open Access-plan

Forskare protesterar i ett öppet brev mot den s k Plan S som de menar kommer att skada särskilt kemisk forskning.

Protester mot gruvor

Från Kallak i norr till Österlen i söder protesterar boende mot planer på ny gruvbrytning.

SwedenBio satsar internationellt

Den nya satsningen kallas International Business Development and Promotion och ska bli ett nav med uppgift att flytta fram positionerna för nordisk life science.

Insplorion ska boosta batterisensor

Statens energimyndighet har beviljat Insplorion två miljoner i stöd för vidareutveckling av Insplorions batterisensor.

Är vi immuna mot gensaxen CRISPR-Cas9

Den frågan ställer sig tyska forskare vid Charité–Universitätsmedizin Berlin som har hittat utbredd immunitet mot Cas9-proteinet.

Största utlysningen inom grön kemi

Mistra startar ett nytt program om grön kemi. Utlysningen har just öppnat till stiftelsens största programsatsning någonsin.

Säljer Europa-rättigheter till Nexium

AstraZeneca säljer rättigheterna till Nexium, uppföljarpreparatet till Losec och båda på top-20-listan över världens mest sålda läkemedel.

Tusen till rekryteringsmässa

1000 mässbesökare och 37 arbetsgivare inom Life Science möttes förra veckan på en rekryteringsmässa i Lund.

Ska hitta biomarkörer för hjärnskada

Digitala pengar dyrast

Energikostnaden för att utvinna digitala s k kryptovalutor, mining som det kallas – är till och med högre än den för att utvinna fysiska metaller.

Luthman och Bogentoft hedras

Cellutech köps av Stora Enso

Stockholmsbaserade startupen Cellutech som utvecklar nya material från trä för att erbjuda hållbara alternativ till fossilbaserade är nu helägt av Stora Enso.

Stängt Kubal sänker elpriset

Mikroplaster i bajs

En ny studie har hittat mikroplastpartiklar i avföringsprover från människor för första gången.

Cellink presenterar nya biobläck

Anställer affärsutvecklare

Läkemedelskongress läggs ner

400-årigt kemibolag byter namn

Ny vd för Probi

Hon tar över ansvaret i Mercodia

Fernströmpris till Huntington-forskare

Se alla Företagens egna nyheter

Sänd till en kollega

0.175