Jättegenom kartlagt

| Av Boel Jönsson | Tipsa redaktionen

Efter fjorton års arbete publicerar forskarna i International Wheat Genome Sequencing Consortium ett utkast och säger att de i stort sett är framme.

Risets genom publicerades 2002, sojabönan 2008, majs 2009. Nu är det dags för vete, världens viktigaste gröda, som förser oss med en femtedel av våra kalorier.

Läs också: Dom i patentstriden om CRISPR-Cas9

Att det har tagit så lång tid beror på att vete har det mest komplexa genomet vi känner till.

Det är enormt stort, med 16 miljarder DNA-bokstäver (kvävebaser). I jämförelse har Arabidopsis 135 miljoner och det humana genomet 3 miljarder bokstäver. Egentligen är vetets genom tre i ett, vilket gör det hela ännu besvärligare.

För ca 500 000 år sedan hybridiserade två gräsarter till en (emmervete). När vi människor domesticerade plantan kom en tredje gräsvariant in i bilden. Därför har modernt brödvete tre par av varje kromosom, en s k hexaploid variant.

Vanligen sekvenseras genom genom att DNA bryts ned i små segment som avläses separat och sedan sätts ihop. Men om varje kromosom förekommer sex gånger blir det väldigt svårt att veta hur det ska ske.

För att göra det ännu värre består 85 procent av vetets genom av repetitiva sekvenser vilket gör det mycket komplicerat att sätta ihop även om man vet vilken kromosom en bit hör till.

Ett vetegenom som släpptes förra året av ett forskarlag vid Johns Hopkins-universitetet (Salzberg) är inte så detaljerat.

Det konsortiet nu har är ett nästan komplett genom av vetesorten Chinese Spring; drygt 107 000 gener är kartlagda i detalj för att vara till nytta för växtförädlare.

Läs också: Globalt avtal om CRISPR

Det viktiga är att förse dem med en bättre verktygslåda, och det kan man redan se. Forskare har hittat en länge eftersökt gen som styr vetestråets uppbyggnad. Med fler kopior av den genen får vetet en solid stjälk istället för ihålig, och blir motståndskraftigare mot torka och insektsangrepp.

Möjligheterna som öppnar sig är många. En är att man kan identifera gener som kodar för de olika veteproteinerna, t ex gluten, vilket gör forskning om vetets egenskaper enklare.

Ett problem för växtförädlare i EU är beslutet nyligen att CRISPR-redigerade genom ska räknas som GMO, även om inga externa gener har tillförts.

Länk till abstract

Shifting the limits in wheat research and breeding using a fully annotated reference genome

Mer om: CRISPR | vetets genom


Håll dig uppdaterad med Kemivärlden Biotech
Är du prenumerant? Bli prenumerant

Med en prenumeration får du obegränsad tillgång till webbtidningen. Läs webbtidningen online.


Skriv din kommentar
Inläggen nedan modereras inte i förväg och omfattas därmed inte av webbplatsens utgivningsbevis.
Startsidan just nu

Lund bland toppuniversitet

Good Food Institute startar ett nytt forskningsprogram, totalt 3 miljoner dollar, om växtbaserade livsmedel och s k Clean Meat (CM).

De tippas få Nobelpris

Mer läkemedelsexport till Kina

Kemiföretagen förutspår en fortsatt god försäljningstillväxt under andra halvan av 2018 visar en färsk konjunkturenkät från IKEM – innovations- och kemiindustrierna.

Äter mikroplastpartiklar

Mygglarver kan äta mikroplastpartiklar som sedan förs över till den vuxna myggan visar en ny studie.

Designar alternativ till antibiotika

Martina Kulén, Kemiska institutionen, Umeå universitet, har i sitt avhandlingsarbete arbetat med utveckling av antivirulens-molekyler mot två olika bakterier.

EU satsar på crowdfunding för startup-bolag

EIT Health lanserar en paneuropeisk plattform för finansiering av små bolag inom life science och hälsa.

Nyhetsbrev

Ny diagnostik för sen Alzheimers

Forskare vid bl a Lunds universitet har utvärderat en ny PET-metod för att hitta proteinet tau i hjärnan på patienter med misstänkt alzheimers.

Arkiv

Studerar signalvägar i realtid

Forskare vid Umeå universitet och Max Planck-institutet för molekylär fysiologi i Dortmund, presenterar en ny kemo-optogenetisk metod för att studera proteinrörelser på cellnivå.

Mer till aktieutdelning än till FoU

Fyra stora läkemedelsbolag lägger systematiskt sina vinster i skatteparadis visar en ny rapport från hjälporganisationen Oxfam.

Låga halter påverkar hormonnivåer

I en ny studie i Environment International rapporterar forskare att de har hittat kopplingar mellan kemikalieblandningar från kosmetika och förändringar i kvinnors fertilitetshormoner.

Hon tar över ansvaret i Mercodia

Fernströmpris till Huntington-forskare

SLU-forskare får Ig Nobelpris

Vid en ceremoni på Harvard University igår fick forskare från bland annat SLU ta emot 2018 års Ig Nobelpris i biologi.

Satsar på etanolproduktion i Rumänien

Clariant investerar 100 miljoner euro i en fabrik för produktion av cellulosaetanol från jordbruksrester i Craiova-regionen i Rumänien.

"Kemikalieskatten driver kunder utomlands"

Plus

Stora förhoppningar på Testa Center

I en ny byggnad på GE Healthcares sajt i Uppsala har nu testbädden för produktion av framtidens biologiska läkemedel officiellt invigts.

Plus

Bra tid för analytiska kemister

Jonathan Sweedler är analytisk kemist som specialiserat sig inom neurokemi, analyser i enstaka neuroner/hjärnceller.

3000 möten på Nordic Life Science Days

I år hölls sjätte omgången av Nordic Life Science Days, SwedenBios årliga event för branschen, med ännu större fokus på partneringmöten.

Nya hörselceller upptäckta

Upptäckten av nya typer av nervceller i innerörat kan leda till nya behandlingar av hörselskador.

Dom i patentstriden om CRISPR-Cas9

Den 10 september beslutade en amerikansk appelationsdomstol att döma till fördel för Broad Institute, MIT, i patentstriden om rättigheterna till CRISPR-Cas9.

De tog hem Startup Challenge

12 startup-bolag tävlade på första kvällen av Nordic Life Science Days 2018. Tre vinnare röstades fram av publiken.

Avfall + avfall = rent

Örebroforskare har tagit fram en metod för att rena lakvatten från gruvavfall och demonstrerat den i en nedlagd gruva.

Zealand Pharma säljer för 1,8 miljarder

Tillfällig direktör på MAX IV

Supersnabb cyaniddetektor

Årets bioteknikbyggare

Patent godkänt i Japan

Ny topp till Sobi

Vaccinbolag anställer

Ny nod för life science och livsmedel

Antikropp mot Parkinsons

Pajalagruvan igång igen

Se alla Företagens egna nyheter

Sänd till en kollega

0.16