Bättre analys av njurcancer

| Av Boel Jönsson | Tipsa redaktionen

Forskare vid Lunds universitet har upptäckt att njurceller inte alltid är samma njurceller i databasens referensprover.

Varje år insjuknar drygt 1 000 personer i någon typ av njurcancer i Sverige. 

Genom att jämföra genuttrycket i tumörceller från njurcancerpatienten med frisk njurvävnad, försöker forskare förstå var i njuren cancern uppkommit och vad som gått fel med dessa celler.

Nu har en forskargrupp på Lunds universitet upptäckt att i den internationella databasen The Cancer Genome Atlas varierar genuttrycket i referensproverna från normal vävnad beroende på var i njuren proverna har råkat bli tagna.

Genom att klargöra vilka prover som motsvarar korrekt vävnad kan analyserna bli bättre. Nu publiceras studien i Cell Reports.

"När vi studerade proverna från databasen, märkte vi att normalproverna uppvisade stor spridning i genuttryck eftersom de har tagits på olika djup i njuren och därför innehåller olika celltyper", säger Håkan Axelson forskargruppsledare och professor i molekylär tumörbiologi i ett pressmeddelande.

De normala referensproverna innehåller alltså olika celltyper beroende på var i njuren provet har råkat bli taget. Eftersom Atlasen inte anger var i njuren referensprovet är taget riskerar man en opålitlig och ibland helt felaktig jämförelse.

"Det är extremt viktigt att veta vad det är som karakteriserar cellerna där tumören uppstår. En bättre förståelse för detta samspel kan ge ökad förståelse för sjukdomsförloppet, som kan ha betydelse för diagnostik och i ett längre perspektiv även val av behandling," kommenterar Håkan Axelson.

The Cancer Genome Atlas – en internationell databas med nästan 1 000 prover från njurtumörer och frisk njurvävnad, sköts av National Cancer Institutes Center for Cancer Genomics och National Human Genome Research Institute finansierat av USAs regering.

Länk till abstract



Håll dig uppdaterad med Kemivärlden Biotech
Är du prenumerant? Bli prenumerant

Med en prenumeration får du obegränsad tillgång till webbtidningen. Läs webbtidningen online.


Skriv din kommentar
Startsidan just nu

Resistent pristagare

Biokompositer ökar i Europa

Den europeiska produktionen av biokompositer nådde 410 000 ton 2017 med den största ökningen, 30 procent, på nya applikationer.

100-åring i Skoghall stoppas

1150 entreprenörer och hundratals av Stora Ensos egna medarbetare ska kommande vecka underhålla, besiktiga och bygga om Skoghalls Bruk på det årliga höststoppet.

Så får vi fart på antibiotikautveckling

Den europeiska branschorganisationen BEAM presenterar i en vitbok förslag till hur man kan få fart på utveckling av ny antibiotika.

Antimikrobiell peptid licensieras ut

Stockholmsbaserade Promore Pharma licensierar ut en av sina antimikrobiella peptider till amerikanska bolaget Transdermal Therapeutic Technologies (TTT).

Nya klorfabriken klar i maj

Nyhetsbrev

Koldioxidutsläppen ökar 2017

Världens koldioxidutsläpp bedöms öka med 2 procent under 2017 vilket ser ut att bero på ökad kolanvändning i Kina.

Arkiv

VD nomineras till hälsominister

En tidigare vd från läkemedelsindustrin nomineras av den amerikanske presidenten till ny hälsominister.

Tveksamhet inför tillsats

Kemiska reaktioner nästa steg

Svenska forskare har i en världsunik mätning klockat tiden för hur lång – eller snarare kort – tid det tar för en elektron i en neon-atom att slitas loss.

Ätbart lim vinner Skapapris

En fuktsensor och ett hårt, ätbart lim var bland uppfinningarna som belönades när årets Skapa-priser delades ut den 9 november på Tekniska Muséet i Stockholm.

Danmark lyfter Medicon Valley

En ny rapport från Öresundsinstitutet, Medicon Valley Alliance visar att den danska delen av life science-klustret fortsätter att gå betydligt bättre än det svenska.

Ny process för textilåtervinning

Efter sex års arbete kan forskare inom Mistra Future Fashion presentera ett genombrott för textilåtervinning av blandtextilier av bomull och polyester.

"Det var inget lätt beslut att fatta"

Två av Recipharms svenska anläggningar läggs ner och 225 anställda berörs av beslutet. Här berättar bolagets vd.

Substitutionscentrum till Borås

Regeringen har beslutat att ett substitutionscentrum inrättas. Centret ska stötta företag som vill byta ut farliga kemikalier i sina varor och placeras vid RISE i Borås.

Bättre stöd till nystartade bolag

Under två år satsar Vinnova i ett pilotprojekt för att utveckla en nationell plattform för effektiv inkubation av nystartade life science-bolag.

Forskare demonstrerar i Berlin

Runt 300 ledande forskare från olika håll i världen demonstrerade vid Brandenburger Tor i samband med konferensen Falling Walls.

Beactica satsar

Bekämpande myggor sätts ut

Ska förändra energimarknaden

Bolags hållbarhetsmål kortsiktiga

Tiaminbrist akut hot mot ejdrar

Sambandet mellan tiaminbrist och misslyckad reproduktion hos ejdern visar att det finns en tydlig koppling mellan biokemi och ekologi.

Stora mängder plast i jordbruksmark

AkzoNobel planerar samgående

Den holländska färg- och kemikoncernen AkzoNobel bekräftar att man för konstruktiva diskussioner om ett samgående.

Nobelprismedalj till salu

AstraZeneca knoppar av doseringsbolag

Fysikalisk kemist prisas

Prisas för nyttiggörande av forskning

Dags att strunta i Nobelpriset?

En miljon till stamcellsforskare

Får Forska!Sveriges hedersutmärkelse

Se alla Företagens egna nyheter

Sänd till en kollega

0.138