Penicillum har mycket mer att ge

| Av Redaktionen Kemivärlden Biotech med Kemisk Tidskrift | Tipsa redaktionen

En veritabel skattkammare av tänkbara läkemedelssubstanser kan finnas i penicillinsvampar, enligt en ny studie i Nature Microbiology som letts av Jens Nielsen, Chalmers.

Det finns mer än 300 arter av Penicillum -svampar - organismer man kan hitta i allt från jord till ost. Den nya studien omfattar 24 arter, nio av dem nyligen sekvenserade.

Forskarna har letat efter genkluster, ansamlingar av gener, som innehåller ritningar för syntes av sekundära metaboliter, som penicillin. Sekundära metaboliter är inte avgörande för svampens tillväxt och utveckling men ger den fördelar när det är aktuellt att avvärja andra mikroorganismer eller när den ska invadera en växt, t ex. Många sekundära metaboliter är svåra att isolera från svampar på labb eftersom förutsättningarna som krävs för att sätta igång produktionen av dem inte är klarlagda.

Genom att scanna efter gener som tillverkar grundstrukturen för några vanliga metaboliter kunde forskarna identifiera hela genkluster med instruktioner för ennzymer i grundsttukturen. Varje kluster producerar olika kemiska strukturer.

Studien hittade mer än 1300 biosyntetiska genkluster i de 24 genomen, ett genomsnitt på mer än 50 per art. Cirka 250 var unika för någon speciell svampart.

Det stora antalet genkluster för sekundära metaboliter man hittade "visar på den outnyttjade potentialen hos filamentösa svampar," kommenterar Jens Nielsen, avdelningen för systembiologi vid Chalmers.

I runt 90 fall kunde Nielsens grupp förutsäga vilka molekyler klustren tillverkade.

För en förening, en fungicid som kallas yanuthone, kunde forskarna koppla kluster till produkt genom att identifiera ämnet i extrakt från två arter man inte visste producerade det.

"Detta är ett väldigt spännande forskningsområde. Framtiden för upptäckter inom läkemedelsforskningen ligger definitivt i den här riktningen, med ett mer genomikbaserat angreppssätt för att hitta småmolekyler från mikroorganismer", kommenterar syntesbiologen Yit Heng Chooi, University of Western Australia, inte inblandad i studien, till cosmosmagazine.com.

Nu blir utmaningen att prioritera bland alla de genkluster man har identifierat, enligt honom.

Nielsens grupp kan nu transplantera hela genkluster till jästceller för att studera de substanser som de ger upphov till i ett system som är fritt från andra sekundära metaboliter. Enzymer från olika kluster kan också blandas och kombineras för att skapa molekyler som inte finns i naturen, enligt Nielsen.

Länk till abstract i Nature Microbiology



Håll dig uppdaterad med Kemivärlden Biotech
Är du prenumerant? Bli prenumerant

Med en prenumeration får du obegränsad tillgång till webbtidningen. Läs webbtidningen online.


Skriv din kommentar
Inläggen nedan modereras inte i förväg och omfattas därmed inte av webbplatsens utgivningsbevis.
Startsidan just nu

Kan bli läkemedelsbrist

Får stora Fernströmpriset för upptäckt om hjärnan

Årets stora nordiska Fernströmpris går till Maiken Nedergaard.

Lund bland toppuniversitet

Good Food Institute startar ett nytt forskningsprogram, totalt 3 miljoner dollar, om växtbaserade livsmedel och s k Clean Meat (CM).

De tippas få Nobelpris

Mer läkemedelsexport till Kina

Kemiföretagen förutspår en fortsatt god försäljningstillväxt under andra halvan av 2018 visar en färsk konjunkturenkät från IKEM – innovations- och kemiindustrierna.

Äter mikroplastpartiklar

Mygglarver kan äta mikroplastpartiklar som sedan förs över till den vuxna myggan visar en ny studie.

Nyhetsbrev

Designar alternativ till antibiotika

Martina Kulén, Kemiska institutionen, Umeå universitet, har i sitt avhandlingsarbete arbetat med utveckling av antivirulens-molekyler mot två olika bakterier.

Arkiv

EU satsar på crowdfunding för startup-bolag

EIT Health lanserar en paneuropeisk plattform för finansiering av små bolag inom life science och hälsa.

Ny diagnostik för sen Alzheimers

Forskare vid bl a Lunds universitet har utvärderat en ny PET-metod för att hitta proteinet tau i hjärnan på patienter med misstänkt alzheimers.

Studerar signalvägar i realtid

Forskare vid Umeå universitet och Max Planck-institutet för molekylär fysiologi i Dortmund, presenterar en ny kemo-optogenetisk metod för att studera proteinrörelser på cellnivå.

Mer till aktieutdelning än till FoU

Fyra stora läkemedelsbolag lägger systematiskt sina vinster i skatteparadis visar en ny rapport från hjälporganisationen Oxfam.

Låga halter påverkar hormonnivåer

I en ny studie i Environment International rapporterar forskare att de har hittat kopplingar mellan kemikalieblandningar från kosmetika och förändringar i kvinnors fertilitetshormoner.

Hon tar över ansvaret i Mercodia

Fernströmpris till Huntington-forskare

SLU-forskare får Ig Nobelpris

Vid en ceremoni på Harvard University igår fick forskare från bland annat SLU ta emot 2018 års Ig Nobelpris i biologi.

Satsar på etanolproduktion i Rumänien

Clariant investerar 100 miljoner euro i en fabrik för produktion av cellulosaetanol från jordbruksrester i Craiova-regionen i Rumänien.

"Kemikalieskatten driver kunder utomlands"

Plus

Stora förhoppningar på Testa Center

I en ny byggnad på GE Healthcares sajt i Uppsala har nu testbädden för produktion av framtidens biologiska läkemedel officiellt invigts.

Plus

Bra tid för analytiska kemister

Jonathan Sweedler är analytisk kemist som specialiserat sig inom neurokemi, analyser i enstaka neuroner/hjärnceller.

3000 möten på Nordic Life Science Days

I år hölls sjätte omgången av Nordic Life Science Days, SwedenBios årliga event för branschen, med ännu större fokus på partneringmöten.

Nya hörselceller upptäckta

Upptäckten av nya typer av nervceller i innerörat kan leda till nya behandlingar av hörselskador.

Dom i patentstriden om CRISPR-Cas9

Den 10 september beslutade en amerikansk appelationsdomstol att döma till fördel för Broad Institute, MIT, i patentstriden om rättigheterna till CRISPR-Cas9.

De tog hem Startup Challenge

12 startup-bolag tävlade på första kvällen av Nordic Life Science Days 2018. Tre vinnare röstades fram av publiken.

Avfall + avfall = rent

Örebroforskare har tagit fram en metod för att rena lakvatten från gruvavfall och demonstrerat den i en nedlagd gruva.

Zealand Pharma säljer för 1,8 miljarder

Supersnabb cyaniddetektor

Årets bioteknikbyggare

Patent godkänt i Japan

Ny topp till Sobi

Vaccinbolag anställer

Ny nod för life science och livsmedel

Antikropp mot Parkinsons

Pajalagruvan igång igen

Se alla Företagens egna nyheter

Sänd till en kollega

0.151