Samarbete kring cancergenomik

| Av Redaktionen Kemivärlden Biotech med Kemisk Tidskrift | Tipsa redaktionen

BM Watson Health och Illumina har bildat ett nytt samarbete kring sekvensering av cancertumörer.

Genom att kombinera sina plattformar kan Watson Health och Illumina skapa ett sekvenseringsflöde som skulle kunna öka tillgänglighet och uppskalning inom området. samarbetet kan också, enligt Watson Healths vice vd Steve Harvey, göra något åt bristen på standardisering.

Amerikanska bolaget Illumina, som grundades 1998, har dominerat sekvenseringsområdet i många år. Bolaget vill nu bli ett bredare genhälsoföretag. I november började man erbjuda en cancerdiagnostikpanel (TruSight Tumor 170) som ett led i den omvandlingen. Trusight tittar på 170 av de mest relevanta cancergenerna och när de sekvenserats kan forskare använda Illuminas mjukvara (BaseSpace) för att omvandla data till s k genetic alteration files.

Sedan kan Watsons teknologi ta vid.

Watson Genomics är en molnbaserad plattform som enligt Harvey kan analysera genetic alteration files på bara några minuter. Allt forskaren behöver göra är att ladda upp filerna och sedan be programmet identifiera de mutationer som mest sannolikt orsakar cancer. Som en del i rapporten kan superdatorn också visa vilka behandlingar som gäller för de mutationerna.

Arbetsflödet skulle kunna användas på många olika sjukdomsområden. Enligt Harvey har bolagen valt att starta med cancer eftersom det är så nära kopplat till genetik och de vetenskapliga processerna varierar stort.

"Vi vill bidra till att försöka standardisera och förenkla tolkningen av genomikdata inom cancerområdet", säger Steve Harvey i ett pressmeddelande.

Exakt vilket protokoll som kommer ut som det "rätta" sättet att sekvensera återstår att se. Hittills har det t ex funnits väldigt lite konsensus om vilka gener som bör analyseras.

Illumina har arbetat med ett flertal institut för att identifiera de 170 generna som ska vara mest relevanta om man vill sekvensera en cancercell.

"De kan sedan sälja tillgång till Watson Genomics rapport som en del i sina reagens kit. Det underlättar avsevärt för diagnostiklabb och cancerforskare att komma igång", kommenterar Harvey.

Plattformen är enbart för forskning men genom att strömlinjeforma processen hoppas bolagen förenkla för forskare att ta sig in på området och utveckla det.


Håll dig uppdaterad med Kemivärlden Biotech
Är du prenumerant? Bli prenumerant

Med en prenumeration får du obegränsad tillgång till webbtidningen. Läs webbtidningen online.


Skriv din kommentar
Startsidan just nu

Positiva resultat för Kancera

Läkemedelsutvecklande bolaget Kancera rapporterar positiva resultat från en Fas I-studie med sin immunreglerande småmolekylära läkemedelskandidat.

Pungdjävlar visar immunitet

Ny forskning tyder på att de tasmanska pungdjuren inte kommer att duka under för den smittsamma cancer som drabbat arten hårt.

Resestipendium till ESOF 2018

Byggstart för ESS Campus

Särlösning för antroposofiska medel bort

Regeringen vill ta bort undantaget som ger möjlighet att ge försäljningstillstånd för antroposofiska medel.

Koffein biomarkör för parkinsons

Nyhetsbrev

Snabb ljusprob identiferar kolhydrater

Svenska forskare har utvecklat en snabb och enkel metod för att kartlägga olika typer av kolhydrater i växtmaterial.

Arkiv

ELISA kan lösa fler narkotikabrott

Ny möjlig princip för cancerterapi

Små molekyler som hämmar ett seleninnehållande enzym visar god effekt mot cancer i musmodeller enligt en studie i Science Translational Medicine.

Biokol kan öka reningsgraden

Kemisten Kristin Blum har i sin avhandling studerat utsläpp av organiska ämnen från små anläggningar och enskilda avlopp och hur reningen kan förbättras.

Metabogen får diabetespatent i USA

Ny nanostruktur i spermiesvansar

Med kryoelektrontomografi har forskare hittat en helt ny nanostruktur inne i spermiernas svansar.

Life assays befarar kapitalbrist

300 miljoner till nya material

Nya upptäckter om gonorre

Strukturstudier av membranproteiner på gonorrebakteriens yta ger förhoppningar om möjliga behandlingar, eventuellt vaccin.

Symcel anställer

Nanofilter fångar blodbakterier

Ett blodfilter i nanoskala som effektivt fångar in bakterier vid dialys har utvecklats av kinesiska forskare.

Tumörvaccin fungerar på möss

Ozonskiktet över oss återhämtar sig inte

Ozonskiktet återhämtar sig vid polerna, men det går sämre vid lägre breddgrader som är bebodda.

Produktkandidat för snabbare sårläkning

Forskare vid Uppsala universitet och SLU har hittat ett nytt sätt att läka sår snabbare med hjälp av mjölksyrabakterier.

Hon ska leda regeringens nya life science-satsning

När Anders Lönnberg ska göra världsutställning så öppnar regeringen ett life science-kontor på regeringskansliet.

Brittiska kemiföretag flyttar ut

Fossilfritt stål möjligt

SSAB, LKAB och Vattenfall planerar att bygga en världsunik pilotanläggning för fossilfritt stål.

Enzymblock testas i ny studie

Att lansera ett block med designade enzymer som ska bryta ned olika läkemedelsrester när man spolar i toaletten, ut mot konsument är svårt.

Vattenpristagare utsedd

Apoteket plockar bort Pcure

Ska hämma stanken

Brexit ger särläkemedel problem

Ny direktör på Pfizer i Sverige

Mer vetenskap i maten

Novo Nordisk lägger nytt bud

Se alla Företagens egna nyheter

Sänd till en kollega

0.169