Samarbete kring cancergenomik

| Av Redaktionen Kemivärlden Biotech med Kemisk Tidskrift | Tipsa redaktionen

BM Watson Health och Illumina har bildat ett nytt samarbete kring sekvensering av cancertumörer.

Genom att kombinera sina plattformar kan Watson Health och Illumina skapa ett sekvenseringsflöde som skulle kunna öka tillgänglighet och uppskalning inom området. samarbetet kan också, enligt Watson Healths vice vd Steve Harvey, göra något åt bristen på standardisering.

Amerikanska bolaget Illumina, som grundades 1998, har dominerat sekvenseringsområdet i många år. Bolaget vill nu bli ett bredare genhälsoföretag. I november började man erbjuda en cancerdiagnostikpanel (TruSight Tumor 170) som ett led i den omvandlingen. Trusight tittar på 170 av de mest relevanta cancergenerna och när de sekvenserats kan forskare använda Illuminas mjukvara (BaseSpace) för att omvandla data till s k genetic alteration files.

Sedan kan Watsons teknologi ta vid.

Watson Genomics är en molnbaserad plattform som enligt Harvey kan analysera genetic alteration files på bara några minuter. Allt forskaren behöver göra är att ladda upp filerna och sedan be programmet identifiera de mutationer som mest sannolikt orsakar cancer. Som en del i rapporten kan superdatorn också visa vilka behandlingar som gäller för de mutationerna.

Arbetsflödet skulle kunna användas på många olika sjukdomsområden. Enligt Harvey har bolagen valt att starta med cancer eftersom det är så nära kopplat till genetik och de vetenskapliga processerna varierar stort.

"Vi vill bidra till att försöka standardisera och förenkla tolkningen av genomikdata inom cancerområdet", säger Steve Harvey i ett pressmeddelande.

Exakt vilket protokoll som kommer ut som det "rätta" sättet att sekvensera återstår att se. Hittills har det t ex funnits väldigt lite konsensus om vilka gener som bör analyseras.

Illumina har arbetat med ett flertal institut för att identifiera de 170 generna som ska vara mest relevanta om man vill sekvensera en cancercell.

"De kan sedan sälja tillgång till Watson Genomics rapport som en del i sina reagens kit. Det underlättar avsevärt för diagnostiklabb och cancerforskare att komma igång", kommenterar Harvey.

Plattformen är enbart för forskning men genom att strömlinjeforma processen hoppas bolagen förenkla för forskare att ta sig in på området och utveckla det.


Håll dig uppdaterad med Kemivärlden Biotech
Är du prenumerant? Bli prenumerant

Med en prenumeration får du obegränsad tillgång till webbtidningen. Läs webbtidningen online.


Skriv din kommentar
Inläggen nedan modereras inte i förväg och omfattas därmed inte av webbplatsens utgivningsbevis.
Startsidan just nu

Kan bli läkemedelsbrist

Får stora Fernströmpriset för upptäckt om hjärnan

Årets stora nordiska Fernströmpris går till Maiken Nedergaard.

Lund bland toppuniversitet

Good Food Institute startar ett nytt forskningsprogram, totalt 3 miljoner dollar, om växtbaserade livsmedel och s k Clean Meat (CM).

De tippas få Nobelpris

Mer läkemedelsexport till Kina

Kemiföretagen förutspår en fortsatt god försäljningstillväxt under andra halvan av 2018 visar en färsk konjunkturenkät från IKEM – innovations- och kemiindustrierna.

Äter mikroplastpartiklar

Mygglarver kan äta mikroplastpartiklar som sedan förs över till den vuxna myggan visar en ny studie.

Nyhetsbrev

Designar alternativ till antibiotika

Martina Kulén, Kemiska institutionen, Umeå universitet, har i sitt avhandlingsarbete arbetat med utveckling av antivirulens-molekyler mot två olika bakterier.

Arkiv

EU satsar på crowdfunding för startup-bolag

EIT Health lanserar en paneuropeisk plattform för finansiering av små bolag inom life science och hälsa.

Ny diagnostik för sen Alzheimers

Forskare vid bl a Lunds universitet har utvärderat en ny PET-metod för att hitta proteinet tau i hjärnan på patienter med misstänkt alzheimers.

Studerar signalvägar i realtid

Forskare vid Umeå universitet och Max Planck-institutet för molekylär fysiologi i Dortmund, presenterar en ny kemo-optogenetisk metod för att studera proteinrörelser på cellnivå.

Mer till aktieutdelning än till FoU

Fyra stora läkemedelsbolag lägger systematiskt sina vinster i skatteparadis visar en ny rapport från hjälporganisationen Oxfam.

Låga halter påverkar hormonnivåer

I en ny studie i Environment International rapporterar forskare att de har hittat kopplingar mellan kemikalieblandningar från kosmetika och förändringar i kvinnors fertilitetshormoner.

Hon tar över ansvaret i Mercodia

Fernströmpris till Huntington-forskare

SLU-forskare får Ig Nobelpris

Vid en ceremoni på Harvard University igår fick forskare från bland annat SLU ta emot 2018 års Ig Nobelpris i biologi.

Satsar på etanolproduktion i Rumänien

Clariant investerar 100 miljoner euro i en fabrik för produktion av cellulosaetanol från jordbruksrester i Craiova-regionen i Rumänien.

"Kemikalieskatten driver kunder utomlands"

Plus

Stora förhoppningar på Testa Center

I en ny byggnad på GE Healthcares sajt i Uppsala har nu testbädden för produktion av framtidens biologiska läkemedel officiellt invigts.

Plus

Bra tid för analytiska kemister

Jonathan Sweedler är analytisk kemist som specialiserat sig inom neurokemi, analyser i enstaka neuroner/hjärnceller.

3000 möten på Nordic Life Science Days

I år hölls sjätte omgången av Nordic Life Science Days, SwedenBios årliga event för branschen, med ännu större fokus på partneringmöten.

Nya hörselceller upptäckta

Upptäckten av nya typer av nervceller i innerörat kan leda till nya behandlingar av hörselskador.

Dom i patentstriden om CRISPR-Cas9

Den 10 september beslutade en amerikansk appelationsdomstol att döma till fördel för Broad Institute, MIT, i patentstriden om rättigheterna till CRISPR-Cas9.

De tog hem Startup Challenge

12 startup-bolag tävlade på första kvällen av Nordic Life Science Days 2018. Tre vinnare röstades fram av publiken.

Avfall + avfall = rent

Örebroforskare har tagit fram en metod för att rena lakvatten från gruvavfall och demonstrerat den i en nedlagd gruva.

Zealand Pharma säljer för 1,8 miljarder

Supersnabb cyaniddetektor

Årets bioteknikbyggare

Patent godkänt i Japan

Ny topp till Sobi

Vaccinbolag anställer

Ny nod för life science och livsmedel

Antikropp mot Parkinsons

Pajalagruvan igång igen

Se alla Företagens egna nyheter

Sänd till en kollega

0.14